Нові антибіотики з’являються рідко. Активні інгредієнти старих часто не дають результату, тому що патогени виробили резистентність до агентів. Зараз дослідники представляють дві багато обіцяючі речовини за короткий час. За цим стоїть новий метод пошуку.
Нові антибіотики проти резистентних бактерій
Застережень не бракує – і було вже багато років. Стійкість до антибіотиків — глобальна загроза здоров’ю людини. Існує нагальна потреба у відкритті нових антибіотиків, механізми дії яких обходять переважаючі механізми резистентності.
Лікарі говорять про стійкість до антибіотиків, коли бактерії, що викликають хворобу, не знищуються антибіотиком – всупереч очікуванням. На початку року міжнародна дослідницька група описала, як часто це трапляється, у журналі The Lancet: за їхньою оцінкою, у 2019 році понад 1,2 мільйона людей у всьому світі померли безпосередньо від інфекції, викликаної стійким патогеном. З огляду на майже п’ять мільйонів смертей, така інфекція була принаймні частково причиною смерті. Це робить стійкість до антибіотиків однією з найпоширеніших причин смерті в усьому світі. Співавтор Кріс Мюррей з Університету Вашингтона підкреслює, що нові антибіотики повинні бути розроблені та випущені на ринок.
Новий комп’ютерний підхід може допомогти: у журналі Science американські дослідники представляють відкриття багато обіцяючого антибіотика, який вони виявили за допомогою цілеспрямованого аналізу геномів бактерій. Активний інгредієнт цилагіцин пошкоджує бактерії за допомогою двох різних механізмів. Це значно знижує ризик резистентності, пише команда під керівництвом Шона Брейді з Університету Рокфеллера в Нью-Йорку.
Новий середник атакує в двох місцях. Це зменшує ризик резистентності
Лише в січні та ж дослідницька група представила ще один новий антибіотик. Хоча обидва активні інгредієнти ще не були протестовані на людях, вони надійно вимикають багато стійких патогенів – як у лабораторії, так і на мишах.
«Ці дані дуже багато обіцяючі», — каже Надін Зімерт, професор трансляційної геноміки природних продуктів в Університетській лікарні в Тюбінгені. Незрозуміло, чи дійсно ці речовини стали використовуватися людьми. Але Брейді каже, що його дослідження також показує, що його підхід до відкриття, щоб з’явилися нові антибіотики працює.
Команда Брейді діяла наступним чином: спочатку дослідники проаналізували близько 10 000 відомих бактеріальних геномів на наявність спадкових факторів, які містять схему так званих ліпопептидів. Відомо, що ця група речовин здатна порушувати ріст бактерій за допомогою різних механізмів.
У своїх пошуках дослідники натрапили на майже 3500 груп генів, які виглядали багато обіцяючими завдяки своєму розміру та структурі. Потім вони зосередилися на тих групах генів, ліпопептиди яких були раніше невідомі. Є надія, що тут будуть знайдені раніше невідомі речовини з новими механізмами дії. На основі проаналізованих ділянок геному вони відтворили в лабораторії вісім речовин. «Молекула, яка виходить у кінці, не обов’язково є тією, яку ці гени створили б у природі», — пояснює Брейді.
Зрештою, одна з восьми речовин, цилагіцин, виявилася ефективною проти всіх представників певної групи бактерій (грампозитивних). Серед них низка хвороботворних мікроорганізмів, сумно відомих у лікарнях та органах охорони здоров’я, включаючи стійкі ентерококи та десяток стійких варіантів страшного раневого мікроба Staphylococcus aureus.
Аналізи показали, що цилагіцин діє проти двох молекул, які важливі для побудови клітинної стінки. Саме цей подвійний механізм, очевидно, запобігає резистентності, оскільки малоймовірно, що бактерія виробить імунітет до обох ефектів одночасно. Але експерименти на мишах спочатку принесли невдачу. Причина: у присутності сироватки крові антимікробний ефект був відсутній. Потім команда створила варіант цилагіцину, який менше зв’язується з сироваткою крові – і таким чином відновлений початковий ефект.